Агенција води следеће регистре као јединствене, централизоване, јавне, електронске базе података:
- Регистар привредних субјеката, у складу са Законом о регистрацији привредних субјеката (почео је са радом 1.01.2005. године). У оквиру овог регистра воде се:
- Регистар привредних друштава (почео је са радом 1.01.2005. године)
- Регистар предузетника (води се од 1. 01.2006. године)
- Регистар страних представништава (води се од 1. 01.2006. године)
- Регистар финансијског лизинга, у складу са Законом о финансијском лизингу (почео је са радом 1.01.2005. године)
- Регистар заложног права на покретним стварима и правима, у складу са Законом о заложном праву на покретним стварима уписаним у регистар (почео је са радом 15.08.2005. године)
- Регистар јавних гласила, у складу са Законом о јавном информисању (почео је са радом 14.10.2009. године)
- Регистар удружења, у складу са Законом о удружењима (почео је са радом 22.10.2009. године)
- Регистар страних удружења, у складу са Законом о удружењима (почео је са радом 22.10.2009. године)
- Регистар туризма, у складу са Законом о туризму (почео је са радом 1.01.2010. године)
- Регистар финансијских извештаја и података о бонитету правних лица и предузетника, у складу са Законом о изменама и допунама Закона о рачуноводству и ревизији (почео је са радом 1.01.2010. године)
- Регистар стечајних маса
- Регистар мера и подстицаја регионалног развоја
- Регистар комора.
Вођење централизованих регистара у јединственој институцији каква је Агенција за привредне регистре - чија се надлежност протеже на целој територији Републике Србије, обезбеђује уједначену праксу регистрације - усаглашену са директивама ЕУ - као и јединствене услове за започињање пословања за све учеснике у привредном животу Србије.
Јединствени централни регистри пружају могућност државним органима и институцијама да се на једном месту упознају са подацима о регистрованим привредним субјектима, њиховим бонитетом, задужењима физичких и правних лица која се односе на финансијски лизинг и залогу на покретним стварима и правима и др.