Законом о регионалном развоју („Сл. Гласник РС“, бр. 51/2009) одређено је да Агенција води Регистар мера и подстицаја регионалног развоја.
У току 2009. године спроведене су све неопходне припремне радње на успостављању софтверског решења за вођење овог регистра и електронску размену података са државним и свим другим институцијама које додељују подстицаје и спроводе мере од значаја за регионални развој као што су: Фонд за развој Републике Србије, Фонд за развој Војводине, Агенција за развој малих и средњих предузећа, Национална служба за запошљавање, Републички Завод за статистику и др.
Почетак рада овог регистра очекује се 2010. године, након усвајања подзаконских аката.